隨著農(nóng)業(yè)部對(duì)養(yǎng)殖廢棄物資源化利用的重視，發(fā)酵制作有機(jī)肥已經(jīng)越來(lái)越受到重視。雖然是有機(jī)肥可以自然發(fā)酵，但發(fā)酵時(shí)間比較長(zhǎng)（一般需要1-3個(gè)月，主要是發(fā)酵溫度較低），而采用專業(yè)發(fā)酵劑可以大幅度縮短發(fā)酵時(shí)間，且發(fā)酵的質(zhì)量更好，這就是為什么有機(jī)肥生產(chǎn)線為什么一定要使用專業(yè)發(fā)酵劑的原因，發(fā)酵時(shí)間的縮短與減少翻堆次數(shù)，直接節(jié)約大量場(chǎng)地與人工等。
我國(guó)國(guó)內(nèi)大多數(shù)有機(jī)肥料產(chǎn)品只堆肥發(fā)酵15-20天，這樣的產(chǎn)品只能達(dá)到無(wú)害化標(biāo)準(zhǔn)。而優(yōu)質(zhì)的有機(jī)肥料堆肥發(fā)酵過(guò)程一般需要45-60天的時(shí)間。
這是因?yàn)樵诙逊是捌诘纳郎仉A段以及高溫階段會(huì)殺死植物致病病原菌、蟲卵、雜草籽等有害微生物，但此過(guò)程中微生物的主要作用是新陳代謝、繁殖，而只產(chǎn)生很少量的代謝產(chǎn)物，并且這些代謝產(chǎn)物不穩(wěn)定也不易被植物吸收。
到后期的降溫期，微生物才會(huì)進(jìn)行有機(jī)物的腐殖質(zhì)化，并在此過(guò)程中產(chǎn)生大量有益于植物生長(zhǎng)吸收的代謝產(chǎn)物，這個(gè)過(guò)程需要45-60天。
經(jīng)此過(guò)程的堆肥可以達(dá)到三個(gè)目的，一是無(wú)害化;二是腐殖質(zhì)化;三是產(chǎn)生大量微生物代謝產(chǎn)物如各種抗生素、蛋白類物質(zhì)等。
有機(jī)肥生產(chǎn)線的發(fā)酵過(guò)程實(shí)際上就是各種微生物新陳代謝、繁殖的過(guò)程，微生物的新陳代謝過(guò)程即有機(jī)物分解的過(guò)程。
